Το κτίριο που στεγάζει σήμερα το Μουσείο κτίστηκε το 1868 - 1870. Στις δύο μεγάλες αίθουσες του Μουσείου είναι συγκεντρωμένα αντικείμενα που σχετίζονται με τα καράβια και τη θάλασσα και φέρουν τον τίτλο «Ναυτική πινακοθήκη». Εμπνευστής και ιδρυτής της Πινακοθήκης από το 1928, ήταν ο γιατρός Ευθ. Βλάμης. Συγκεντρώθηκαν τότε, πίνακες ιστιοφόρων, ναυτικά όργανα, και ακρόπρωρα που αποτέλεσαν το πρώτο υλικό. Από τα εκθέματα της πινακοθήκης, αξιολογότερα είναι πίνακες ιστιοφόρων, ακρόπρωρα με ξυλόγλυπτες γυναικείες μορφές, ναυτικά όργανα, ημερολόγια των πλοίων, νηολόγια των Γαλαξιδιώτικων καραβιών και οι πίνακες του λαϊκού ζωγράφου και καπετάνιου Πέτρου Πετραντζά. Επίσης σε ειδική προθήκη, φυλάσσεται το «Χρονικό του Γαλαξειδίου», το οποίο εκδόθηκε από τον Κ. Ν. Σάθα, το 1865.